JCself folgt dem Prinzip der Selbstorganisation. Es wählt Töne zunächst zufällig. Jeder Ton, der einmal erklungen ist, wird danach wahrscheinlicher. So bildet sich ein Schwerpunkt heraus, den niemand festgelegt hat.

Der Physiker Hermann Haken hat dafür den Begriff Synergetik geprägt: Aus vielen ungeordneten Teilen bildet sich ein Ordner, eine bestimmende Größe, nach der sich dann alle anderen Teile richten. In JCself ist das der häufigste Ton. Er bestimmt Dauer, Lautstärke, Raumklang und Nebenstimmen aller anderen Töne.

Nach demselben Prinzip entstehen Trampelpfade, Ameisenstraßen und Flussläufe, und auch die Evolution arbeitet mit Zufall, Auswahl und Gedächtnis. Der Komponist gibt nur den Rahmen vor: Tonraum, Tempo, Instrumente. Innerhalb dieses Rahmens komponiert die Musik sich selbst, und jedes Mal anders.

JCself erzeugt MIDI-Dateien sowie Orchestra- und Score-Dateien zur weiteren Verarbeitung mit dem Programm Csound. Das Programm wurde von Nils Kay und Peter Heeren entwickelt.